A série acompanha Aki Light, um robô avançado que parece e vive como um miúdo normal em idade escolar. Mora em Silicon City, uma cidade onde humanos e robôs coexistem pacificamente. No entanto, quando descobre que se pode transformar no incrível super-herói MegaMan, a sua missão passa a ser proteger a cidade dos mestres robôs que semeiam o pânico!